RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527006.1

TSTA3-205, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-205ENST00000527006 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 LEFTY2O00292 366 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 IGLV3-27P01718 113 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CHKAP35790 457 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 HTR3DQ70Z44 454 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 OTUB2Q96DC9 234 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 HES6Q96HZ4 224 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 EPAS1Q99814 870 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 GKN1Q9NS71 199 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 FZD10Q9ULW2 581 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.87□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 MBTPS2O43462 519 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ACSL4O60488 711 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 STC2O76061 302 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 RARAP10276 462 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 IRF1P10914 325 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ARL4AP40617 200 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 COPS2P61201 443 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ADGRF1Q5T601 910 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 VSIG1Q86XK7 387 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 YAF2Q8IY57 180 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 EXD1Q8NHP7 514 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 HSPH1Q92598 858 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 NXPE3Q969Y0 559 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 PBKQ96KB5 322 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ASB16Q96NS5 453 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SLC22A12Q96S37 553 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 POMKQ9H5K3 350 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 DNAI1Q9UI46 699 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.86□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 H3BRJ5 948 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 DAPK3O43293 454 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 LAMP2P13473 410 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 PRLRP16471 622 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 L1CAMP32004 1257 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 GJC1P36383 396 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 KCNQ1P51787 676 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TAS2R40P59535 323 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TUBB2AQ13885 445 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 DENND1CQ8IV53 801 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TTC16Q8NEE8 873 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 KIF18AQ8NI77 898 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CD101Q93033 1021 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 SIK2Q9H0K1 926 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.85□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 LRRD1A4D1F6 860 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF487B1APH4 448 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 F5H5T6 163 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 PAGE1O75459 146 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 KRT1P04264 644 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CYBBP04839 570 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 KDELR1P24390 212 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 HCAR3P49019 387 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 CDH6P55285 790 aa14.84□□□□□ -0.03
TSTA3-205ENST00000527006 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms