RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 NME8Q8N427 588 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 D2HGDHQ8N465 521 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC148Q8NFR7 591 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 OR7D4Q8NG98 312 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MDM1Q8TC05 714 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RAD9AQ99638 391 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PXMP2Q9NR77 195 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 INSL6Q9Y581 213 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 LAMA3Q16787 3333 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0C4DFX4 3053 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CAPN14A8MX76 684 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 DAPK3O43293 454 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MTSS1O43312 755 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SLC26A4O43511 780 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RB1P06400 928 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MMP3P08254 477 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MYL3P08590 195 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 IQCF3P0C7M6 154 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CSF2RAP15509 400 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 XBP1P17861 261 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PSMA5P28066 241 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 GNA11P29992 359 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PTTG1IPP53801 180 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SLC16A1P53985 500 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CNTN2Q02246 1040 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PTGISQ16647 500 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 QRICH1Q2TAL8 776 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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HDAC2-216ENST00000523628 GALNT17Q6IS24 598 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 FBXL16Q8N461 479 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SLC35B2Q8TB61 432 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF480Q8WV37 535 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SEPT8Q92599 483 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MAP4K1Q92918 833 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 HDAC10Q969S8 669 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 FAM227BQ96M60 508 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PRRX2Q99811 253 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MYOCQ99972 504 aa4.72□□□□□ -1.65
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HDAC2-216ENST00000523628 SDF4Q9BRK5 362 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 AZI2Q9H6S1 392 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 BCO1Q9HAY6 547 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PARPBPQ9NWS1 579 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ERAP1Q9NZ08 941 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 COL1A2P08123 1366 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 NFASCO94856 1347 aa4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 NCOR1O75376 2440 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2QL1A1L167 161 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 C17orf102A2RUQ5 167 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 H3BML4 177 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 CTAGE5O15320 804 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 CDKL5O76039 1030 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 PEX11BO96011 259 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 SBK3P0C264 359 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 STAG3L1P0CL83 205 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 TMOD1P28289 359 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 ECHS1P30084 290 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 WNT3AP56704 352 aa4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 TLE1Q04724 770 aa4.71□□□□□ -1.66
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