RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514536.5

USP46-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 2

Gene USP46, Length 1,589 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-209ENST00000514536 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TRNP1Q6NT89 227 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 EMC1Q8N766 993 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 PRSS33Q8NF86 280 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 DDI1Q8WTU0 396 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 AZIN2Q96A70 460 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 CHRDQ9H2X0 955 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 DEC1Q9P2X7 70 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TRIM24O15164 1050 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 APODP05090 189 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 KRT3P12035 628 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SULT1E1P49888 294 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 MRE11P49959 708 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 NUBP1P53384 320 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 KDSRQ06136 332 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 MTAPQ13126 283 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 GAS6Q14393 721 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 FYB2Q5VWT5 728 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 Q6ZS52 159 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ARCQ7LC44 396 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 NT5C3BQ969T7 300 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TBCBQ99426 244 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.49□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 K7EQS6 105 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 CACNG3O60359 315 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 KAT7O95251 611 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TPM1P09493 284 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SLC2A3P11169 496 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 GZMAP12544 262 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 PDGFRAP16234 1089 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 RRM1P23921 792 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SLC6A4P31645 630 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 CCR1P32246 355 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 GRIA2P42262 883 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 DEUP1Q05D60 604 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 FBXO43Q4G163 708 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 MPPE1Q53F39 396 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TMC6Q7Z403 805 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 PIGVQ9NUD9 493 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.48□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 A0A0A0MRY4 1105 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ANTXRLA6NF34 631 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 GFRA2O00451 464 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 RNF40O75150 1001 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 RTN2O75298 545 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 F9P00740 461 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 CISD3P0C7P0 127 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ABCB4P21439 1286 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 DGKGP49619 791 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SGSHP51688 502 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SEC13P55735 322 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ATP11AP98196 1134 aa14.47□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms