RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SCNM1Q9BWG6 230 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 GPR174Q9BXC1 333 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ITM2CQ9NQX7 267 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 PCDH15Q96QU1 1955 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 USP24Q9UPU5 2620 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 KCNJ18B7U540 433 aa17.67■□□□□ 0.42
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HERC3-211ENST00000513325 GNSP15586 552 aa17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 TPMTP51580 245 aa17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHG6Q3KR16 790 aa17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 WDR45BQ5MNZ6 344 aa17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ISM2Q6H9L7 571 aa17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 TFAP2BQ92481 460 aa17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SIPA1Q96FS4 1042 aa17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ADAM33Q9BZ11 813 aa17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ABCC13Q9NSE7 274 aa17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SUSD2Q9UGT4 822 aa17.67■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1257Q9ULG3 409 aa17.67■□□□□ 0.42
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HERC3-211ENST00000513325 TIMM44O43615 452 aa17.66■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 EPHX1P07099 455 aa17.66■□□□□ 0.42
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HERC3-211ENST00000513325 ARID5AQ03989 594 aa17.66■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 E2F5Q15329 346 aa17.66■□□□□ 0.42
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HERC3-211ENST00000513325 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa17.66■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 CACUL1Q86Y37 369 aa17.66■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
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HERC3-211ENST00000513325 PIK3R2O00459 728 aa17.65■□□□□ 0.42
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HERC3-211ENST00000513325 HLA-EP13747 358 aa17.65■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 HLA-FP30511 346 aa17.65■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 OXTRP30559 389 aa17.65■□□□□ 0.42
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HERC3-211ENST00000513325 ADGRF1Q5T601 910 aa17.65■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 LCLAT1Q6UWP7 414 aa17.65■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SLC35F5Q8WV83 523 aa17.65■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 DNASE2BQ8WZ79 361 aa17.65■□□□□ 0.42
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HERC3-211ENST00000513325 TIGD1Q96MW7 591 aa17.65■□□□□ 0.42
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HERC3-211ENST00000513325 ZSWIM1Q9BR11 485 aa17.65■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 STOML2Q9UJZ1 356 aa17.65■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa17.65■□□□□ 0.42
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HERC3-211ENST00000513325 GJB3O75712 270 aa17.64■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 ACADMP11310 421 aa17.64■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CD44P16070 742 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 ZNF445P59923 1031 aa17.64■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 CCDC40Q4G0X9 1142 aa17.64■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 PMF1Q6P1K2 205 aa17.64■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CHST9Q7L1S5 443 aa17.64■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 SCML4Q8N228 414 aa17.64■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa17.64■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 PCNX2A6NKB5 2137 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GTW7 788 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 LATS1O95835 1130 aa17.63■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 IGLV3-19P01714 112 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 BRD2P25440 801 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 GRIK2Q13002 908 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CNGA2Q16280 664 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 DCAF12L1Q5VU92 463 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 MSANTD2Q6P1R3 559 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 ADIPOR2Q86V24 386 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 FAM124AQ86V42 546 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 OR2T3Q8NH03 318 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 LMO3Q8TAP4 145 aa17.63■□□□□ 0.41
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