RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 TSPAN3O60637 253 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 DAB1O75553 588 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 APODP05090 189 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 FERP16591 822 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PLA2G5P39877 138 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 NBL1P41271 181 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 TNFRSF4P43489 277 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 CCR3P51677 355 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 SEC13P55735 322 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF445P59923 1031 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 CDK17Q00537 523 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 CENPCQ03188 943 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 DMWDQ09019 674 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 RNF43Q68DV7 783 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 RFWD3Q6PCD5 774 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 TRIM72Q6ZMU5 477 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 TERB1Q8NA31 727 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 NPY6RQ99463 290 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 TBC1D3BA6NDS4 549 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 KCNU1A8MYU2 1149 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PRRT4C9JH25 899 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 NOS2P35228 1153 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 FLT3P36888 993 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 MATKP42679 507 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC11A2P49281 568 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 C2orf27AQ580R0 203 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PIK3R6Q5UE93 754 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 GRAMD4Q6IC98 578 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 RNF214Q8ND24 703 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 R4GN57 208 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PROB1E7EW31 1015 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 GOLGA8SH3BPF8 625 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 I6L893 689 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ATG13O75143 517 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 HOXA6P31267 233 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PRKCIP41743 596 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 DGKGP49619 791 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 MPPE1Q53F39 396 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 MON1BQ7L1V2 547 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 SYT13Q7L8C5 426 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 BNIPLQ7Z465 357 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 IL17RCQ8NAC3 791 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 DDI1Q8WTU0 396 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM122AQ96E09 287 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ANLNQ9NQW6 1124 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 DDIT4Q9NX09 232 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 TAS2R14Q9NYV8 317 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 STARD13Q9Y3M8 1113 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A1W2PQJ5 194 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 M0QYT0 321 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ADAM23O75077 832 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 GJB6O95452 261 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 TIE1P35590 1138 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 GEN1Q17RS7 908 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 C10orf76Q5T2E6 689 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 SFMBT2Q5VUG0 894 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ARCQ7LC44 396 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC33Q8N5R6 958 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ALLCQ8N6M5 410 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 NUP58Q9BVL2 599 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 HAUS4Q9H6D7 363 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM204AQ9H8W3 233 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PIGVQ9NUD9 493 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP2-225ENST00000513069 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 SGK1O00141 431 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 AP5Z1O43299 807 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 LILRB5O75023 590 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CYBBP04839 570 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 GYPCP04921 128 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC172P0C7W6 258 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms