RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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SH3BP2-220ENST00000511663 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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SH3BP2-220ENST00000511663 M0QYV0 167 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-220ENST00000511663 PMM2O15305 246 aa20.06■□□□□ 0.8
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