RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 C9IYK1 514 aa5.85□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 KIAA0355O15063 1070 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 MGEA5O60502 916 aa5.85□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 POMCP01189 267 aa5.85□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.473e-6■■■■□ 24.1
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ARHGEF3-215ENST00000498517 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM161AQ9NX61 479 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBX21Q9UL17 535 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTUS1Q9ULD2 1270 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNX24Q9Y343 169 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 NR2E1Q9Y466 385 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.85□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANK1P16157 1881 aa5.84□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 GMNCA6NCL1 334 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 KPNA7A9QM74 516 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD65E5RJM6 399 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 E7EVH7 732 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAPPC3O43617 180 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 NDUFB5O43674 189 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPOPO43791 374 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 HUS1O60921 280 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 TADA2AO75478 443 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 VNN1O95497 513 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM107AO95990 144 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASS1P00966 412 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEACAM5P06731 702 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 MMEP08473 750 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAEPP09466 180 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUDT17P0C025 328 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYP11B1P15538 503 aa5.84□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 NTF4P34130 210 aa5.84□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 LIG3P49916 1009 aa5.84□□□□□ -1.47
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