RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	PRSS50	Q9UI38	385 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	HTT	P42858	3142 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	NFASC	O94856	1347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293		A0A1W2PPC1	479 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	LEFTY2	O00292	366 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	ATP9A	O75110	1047 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM127	O75204	238 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	KATNA1	O75449	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	FSBP	O95073	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	ABHD16A	O95870	558 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	LGALS2	P05162	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	LGALS4	P56470	323 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	FPGS	Q05932	587 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61	3e-15	■■□□□ 11.9
RBM39-240	ENST00000495293	BIRC2	Q13490	618 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	PRR16	Q569H4	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	BAD	Q92934	168 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293		H3BQV1	296 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	JAK2	O60674	1132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	LARGE1	O95461	756 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	CD4	P01730	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	MMP1	P03956	469 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	AR	P10275	920 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	ACTN1	P12814	892 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	KCNA2	P16389	499 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	SFN	P31947	248 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	CIITA	P33076	1130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	RFC2	P35250	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	SLC26A2	P50443	739 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	ACTR2	P61160	394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	STAT4	Q14765	748 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293		Q4G0T1	1027 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293		Q6YL49	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	KAT2B	Q92831	832 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-240	ENST00000495293	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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