RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	CPXM1	Q96SM3	734 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NPAS2	Q99743	824 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	EURL	Q9NYK6	297 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	UBP1	Q9NZI7	540 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1B0GUL6	1792 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	THRA	P10827	490 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	LCP1	P13796	627 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ARL4A	P40617	200 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	WASHC5	Q12768	1159 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PTK2B	Q14289	1009 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MYLK3	Q32MK0	819 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB6C	Q53S08	254 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PODN	Q7Z5L7	613 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GPR141	Q7Z602	305 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TPH1	P17752	444 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NUMB	P49757	651 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	IDH3A	P50213	366 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC18A1	P54219	525 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PTP4A2	Q12974	167 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	KLF10	Q13118	480 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	LPIN1	Q14693	890 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NEDD8	Q15843	81 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CIB1	Q99828	191 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF302	Q9NR11	478 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ITGAX	P20702	1163 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	AMHR2	Q16671	573 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF19	Q2TAC6	998 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	DDI1	Q8WTU0	396 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CGRRF1	Q99675	332 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TMX2	Q9Y320	296 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ADORA2B	P29275	332 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	STT3A	P46977	705 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NAGLU	P54802	743 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP3K10	Q02779	954 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RALGDS	Q12967	914 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	DLG2	Q15700	870 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NUP93	Q8N1F7	819 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	WDR41	Q9HAD4	459 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNK1	O00180	336 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	P4HA1	P13674	534 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ME2	P23368	584 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	THOP1	P52888	689 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	IL1RL1	Q01638	556 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MTX3	Q5HYI7	312 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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