RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 CETPP11597 493 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FCER1AP12319 257 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SCG2P13521 617 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MPLP40238 635 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 VAV2P52735 878 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 NAPAP54920 295 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CDC42EP1Q00587 391 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2R5BQ15173 497 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-211ENST00000484135 GEN1Q17RS7 908 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PRR16Q569H4 304 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FAM173BQ6P4H8 233 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FAM160B2Q86V87 743 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-211ENST00000484135 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-211ENST00000484135 CAGE1Q8TC20 777 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TBC1D5Q92609 795 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-211ENST00000484135 PGBD1Q96JS3 809 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 C8orf76Q96K31 380 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MED15Q96RN5 788 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SPZ1Q9BXG8 430 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-211ENST00000484135 TXNRD2Q9NNW7 524 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TLK1Q9UKI8 766 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 DMTF1Q9Y222 760 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CDYLQ9Y232 598 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RIPK3Q9Y572 518 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RLFQ13129 1914 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 STK36Q9NRP7 1315 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SMCO2A6NFE2 343 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 KIF28PB7ZC32 967 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 GRM6O15303 877 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 STX6O43752 255 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CNMDO75829 334 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 WASP42768 502 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 NLRP5P59047 1200 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 C1QTNF8P60827 252 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-211ENST00000484135 INAVAQ3KP66 663 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 WDR78Q5VTH9 848 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 VOPP1Q96AW1 172 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 FAXDC2Q96IV6 333 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP26Q9BV47 211 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 HOXC10Q9NYD6 342 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CPA4Q9UI42 421 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CCPG1Q9ULG6 757 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MTMR6Q9Y217 621 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PARP14Q460N5 1801 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 LOC285556D6RIA3 1793 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 BTBD18B2RXH4 712 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MASP2O00187 686 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G6O60733 806 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 AGFG2O95081 481 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ZFPL1O95159 310 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ICAM1P05362 532 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CD1AP06126 327 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SMARCA1P28370 1054 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 DDIT3P35638 169 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 UBXN2AP68543 259 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MTMR1Q13613 665 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 IL10RAQ13651 578 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM29Q14134 588 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.32□□□□□ -1.56
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