RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483268.1

RHBDD1-212, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-212ENST00000483268 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 TMX1Q9H3N1 280 aa6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 ZNF302Q9NR11 478 aa6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 PRSS50Q9UI38 385 aa6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.51□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 EVPLQ92817 2033 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 GRM6O15303 877 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 MSH4O15457 936 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 ADH4P08319 380 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 FAM189BP81408 668 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 SLC25A3Q00325 362 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 CAMK1Q14012 370 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 PRR16Q569H4 304 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 BICD2Q8TD16 824 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 NEK9Q8TD19 979 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.5□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 NID2Q14112 1375 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 TLDC2A0PJX2 215 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 MGEA5O60502 916 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 GPR32O75388 356 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 STC2O76061 302 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 STBD1O95210 358 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 CYP3A7P24462 503 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 NLRP5P59047 1200 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 NPY5RQ15761 445 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 PTPROQ16827 1216 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 RABL3Q5HYI8 236 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 USP7Q93009 1102 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 GJA10Q969M2 543 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 AIFM3Q96NN9 605 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 RIT2Q99578 217 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 IFT22Q9H7X7 185 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 RGS18Q9NS28 235 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.49□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 COL1A2P08123 1366 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 M0QZ92 97 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 MAGEB2O15479 319 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 NCK2O43639 380 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 DTNBO60941 627 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 RPS6KA5O75582 802 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 PSMD10O75832 226 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 C22orf31O95567 290 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 STAG3L1P0CL83 205 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 KCNA5P22460 613 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 DNAJB1P25685 340 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 CASRP41180 1078 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 GATMP50440 423 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 INHBCP55103 352 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 STK3Q13188 491 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 Q4G0T1 1027 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 DOK3Q7L591 496 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RHBDD1-212ENST00000483268 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms