RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466971.1

NFX1-206, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 5

Gene NFX1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-206	ENST00000466971	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971		M0QYT0	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	AP3B1	O00203	1094 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PIK3R2	O00459	728 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ENPP3	O14638	875 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ALOX15B	O15296	676 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PRMT3	O60678	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ATP2C2	O75185	946 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GRAP2	O75791	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IFNB1	P01574	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LTF	P02788	710 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ADH1A	P07327	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GSTA2	P09210	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC2A3	P11169	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NCAM1	P13591	858 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TCF4	P15884	667 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NR1D1	P20393	614 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MX2	P20592	715 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FGFR3	P22607	806 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CYP2F1	P24903	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	WEE1	P30291	646 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	L1CAM	P32004	1257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MAGEA6	P43360	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	OR1G1	P47890	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	DYNLT1	P63172	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CAP1	Q01518	475 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GPS1	Q13098	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PDK1	Q15118	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TRADD	Q15628	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HIF1A	Q16665	826 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	VAT1	Q99536	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SMO	Q99835	787 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HINFP	Q9BQA5	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SENP1	Q9P0U3	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CLUH	O75153	1309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971		E7ESA3	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971		E7EVH7	732 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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