RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1-208ENST00000466278 CREB5Q02930 508 aa23.74■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 KCNJ12Q14500 433 aa23.74■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 TMEM110Q86TL2 294 aa23.74■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 RLN3Q8WXF3 142 aa23.74■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 CD248Q9HCU0 757 aa23.74■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 CYTH4Q9UIA0 394 aa23.74■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.74■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 TSPAN3O60637 253 aa23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 FYNP06241 537 aa23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 PTK2Q05397 1052 aa23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 MAP7D1Q3KQU3 841 aa23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 CLEC4EQ9ULY5 219 aa23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 TLR6Q9Y2C9 796 aa23.73■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 CAPN9O14815 690 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 SLC30A4O14863 429 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 IRAK2O43187 625 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 STARD3Q14849 445 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 KIAA1211LQ6NV74 962 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 LPCAT2Q7L5N7 544 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 CYP2U1Q7Z449 544 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 GPT2Q8TD30 523 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 AZIN2Q96A70 460 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 ELOVL2Q9NXB9 296 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 RAD54BQ9Y620 910 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 STON1Q9Y6Q2 735 aa23.72■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 MAP3K13O43283 966 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 GDF9O60383 454 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 ACSL4O60488 711 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 CAVIN2O95810 425 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 NDUFV2P19404 249 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 MPP7Q5T2T1 576 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 TAC4Q86UU9 113 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 NOX5Q96PH1 765 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 CIPCQ9C0C6 399 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 SMOC1Q9H4F8 434 aa23.71■■□□□ 1.39
MKL1-208ENST00000466278 LAMA1P25391 3075 aa23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 ZNF217O75362 1048 aa23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 HLA-FP30511 346 aa23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 IL12RB1P42701 662 aa23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 ENPP2Q13822 863 aa23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 SPDYCQ5MJ68 293 aa23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 PASD1Q8IV76 773 aa23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 LHX5Q9H2C1 402 aa23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 CEP83Q9Y592 693 aa23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 CKAP5Q14008 2032 aa23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 WASH3PC4AMC7 463 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 TIMM44O43615 452 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 KRT9P35527 623 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 SGSHP51688 502 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 LIMK1P53667 647 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 BPIFB4P59827 614 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 ARID5AQ03989 594 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 PIK3R6Q5UE93 754 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 RNF43Q68DV7 783 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 RFWD3Q6PCD5 774 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 SLC36A4Q6YBV0 504 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 FRMD1Q8N878 549 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 ADAM32Q8TC27 787 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 SLC39A13Q96H72 371 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 CPXM1Q96SM3 734 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 CEP192Q8TEP8 1941 aa23.69■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa23.68■■□□□ 1.38
MKL1-208ENST00000466278 TBL1XO60907 577 aa23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms