RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM84AQ96KN4 292 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 TRIB1Q96RU8 372 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 LMF1Q96S06 567 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 MAST3O60307 1309 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 WDR90Q96KV7 1748 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 TISP43B9A030 160 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 NOBOXO60393 691 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 COQ9O75208 318 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 GLP2RO95838 553 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 ADD2P35612 726 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 EPS15P42566 896 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF134P52741 427 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 LILRA4P59901 499 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 TTC22Q5TAA0 569 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 SYT12Q8IV01 421 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 RAI14Q9P0K7 980 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 FEM1BQ9UK73 627 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 CA14Q9ULX7 337 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 MYH13Q9UKX3 1938 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 HMX3A6NHT5 357 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 PIAS2O75928 621 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 ACTL6BO94805 426 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 RASAL1O95294 804 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 INHBBP09529 407 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 YY1P25490 414 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 PPP2CBP62714 309 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 PPP2CAP67775 309 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 MECOMQ03112 1051 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 KRT17Q04695 432 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 MANEALQ5VSG8 457 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 METRNLQ641Q3 311 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 RETSATQ6NUM9 610 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 CPOQ8IVL8 374 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 CNTROBQ8N137 903 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 TEKT1Q969V4 418 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 NEU1Q99519 415 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 MRIQ9BWK5 157 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 HACL1Q9UJ83 578 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 HPSEQ9Y251 543 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 RAD54BQ9Y620 910 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 DOCK2Q92608 1830 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF4B-204ENST00000466185 GAKO14976 1311 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms