RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 TCF15Q12870 199 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 PTP4A2Q12974 167 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 GRM4Q14833 912 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 IQCB1Q15051 598 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 KYNUQ16719 465 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 CACHD1Q5VU97 1274 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 AFMIDQ63HM1 303 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF449Q6P9G9 518 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 CD300LDQ6UXZ3 194 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIM74Q86UV6 250 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIM73Q86UV7 250 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 TRABD2AQ86V40 505 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 THNSL1Q8IYQ7 743 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 NUP93Q8N1F7 819 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM46DQ8NEK8 389 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 REPS2Q8NFH8 660 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 RUFY2Q8WXA3 655 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 CLIC6Q96NY7 704 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SPAG5Q96R06 1193 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 IWS1Q96ST2 819 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 CD180Q99467 661 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 BDH2Q9BUT1 245 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SYNPO2LQ9H987 977 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 TRPV4Q9HBA0 871 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 EHD2Q9NZN4 543 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 KCND2Q9NZV8 630 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM30AQ9NZY2 134 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 RSPH14Q9UHP6 348 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 KCND3Q9UK17 655 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 RABL2BQ9UNT1 228 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 ATRNL1Q5VV63 1379 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 ADAMTS20P59510 1910 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SHROOM2Q13796 1616 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 MYO1GB0I1T2 1018 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 PEX12O00623 359 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 FFAR3O14843 346 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 RGS10O43665 173 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 CDKL5O76039 1030 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SEC14L2O76054 403 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 KIAA0754O94854 1291 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 KLHL18O94889 574 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 RASAL1O95294 804 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 TGDSO95455 350 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 JUNP05412 331 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SPARCP09486 303 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 WEE2P0C1S8 567 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SBK3P0C264 359 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 THEGLP0DJG4 465 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 PRKCHP24723 683 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 KIF5BP33176 963 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 ADCY8P40145 1251 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 RGS2P41220 211 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 HNF4AP41235 474 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 MEOX1P50221 254 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SLURP1P55000 103 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 RWDD2BP57060 319 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 CAP1Q01518 475 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 PPARDQ03181 441 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 ASIC2Q16515 512 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 CRB2Q5IJ48 1285 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 CBWD5Q5RIA9 395 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 MANEALQ5VSG8 457 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SARM1Q6SZW1 724 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC22A25Q6T423 547 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 SASS6Q6UVJ0 657 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-205ENST00000460278 LAYNQ6UX15 382 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms