RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CALCA	P01258	141 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	HMBS	P08397	361 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NR1I3	Q14994	352 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TAC4	Q86UU9	113 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	LOXL4	Q96JB6	756 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DES	P17661	470 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC6A11	P48066	632 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CENPC	Q03188	943 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	GAS6	Q14393	721 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	XYLT1	Q86Y38	959 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PASD1	Q8IV76	773 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CCR1	P32246	355 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DPP6	P42658	865 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FMO1	Q01740	532 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	KDSR	Q06136	332 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC12A1	Q13621	1099 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	C12orf40	Q86WS4	652 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TSPY26P	Q9H489	355 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	RAB23	Q9ULC3	237 aa		11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PRR23A	A6NEV1	266 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	LRP3	O75074	770 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ASL	P04424	464 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	MME	P08473	750 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ABCB4	P21439	1286 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PRKCI	P41743	596 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	KLK7	P49862	253 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FANCC	Q00597	558 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM14	Q14142	442 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160		Q6ZS52	159 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	RASSF3	Q86WH2	238 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DEFB106A	Q8N104	65 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	AHI1	Q8N157	1196 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	KDM1B	Q8NB78	822 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NT5C3B	Q969T7	300 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	MMP8	P22894	467 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	MRE11	P49959	708 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ASIC2	Q16515	512 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	GAB3	Q8WWW8	586 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NPY6R	Q99463	290 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	GABRG3	Q99928	467 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ACP6	Q9NPH0	428 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CHRNB2	P17787	502 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NTSR1	P30989	418 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	11.42	□□□□□ -0.58	2e-6	■■■□□ 16
UBXN7-205	ENST00000429160	PIK3R2	O00459	728 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	C7	P10643	843 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ENPP2	Q13822	863 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	C5orf22	Q49AR2	442 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TAF3	Q5VWG9	929 aa		11.41	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NAA35	Q5VZE5	725 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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