RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF276Q8N554 614 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN4-202ENST00000415164 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN4-202ENST00000415164 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN4-202ENST00000415164 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN4-202ENST00000415164 PLD4Q96BZ4 506 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN4-202ENST00000415164 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.21■□□□□ 0.83
UBXN4-202ENST00000415164 A0A1B0GVT2 93 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 TAF4O00268 1085 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CD19P15391 556 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 RAD23BP54727 409 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 NFIL3Q16649 462 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 MPPE1Q53F39 396 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM215Q68D42 235 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 PROSER1Q86XN7 944 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CPXM2Q8N436 756 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 TTC39CQ8N584 583 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 EDEM1Q92611 657 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 TATDN2Q93075 761 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 LHX5Q9H2C1 402 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 RAB20Q9NX57 234 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 HESX1Q9UBX0 185 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 HPSEQ9Y251 543 aa20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 TULP2O00295 520 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 GTF2H1P32780 548 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 KRT85P78386 507 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 ADIGQ0VDE8 80 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 DPYDQ12882 1025 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 ENPP2Q13822 863 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 HLA-BQ31612 363 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC157Q569K6 752 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CHST9Q7L1S5 443 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 OR2T3Q8NH03 318 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.19■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 STX10O60499 249 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 PDE4CQ08493 712 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 RAB41Q5JT25 222 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 UBA3Q8TBC4 463 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CETN3O15182 167 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 TIMM44O43615 452 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 FSBPO95073 299 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 LCP1P13796 627 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 ACSL1P33121 698 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 BCAT1P54687 386 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 BNC1Q01954 994 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 SGO2Q562F6 1265 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 MDM1Q8TC05 714 aa20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CBFA2T3O75081 653 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 DNTTP04053 509 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 HLA-FP30511 346 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 ENPEPQ07075 957 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 LRMPQ12912 555 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 TEAD4Q15561 434 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 LAYNQ6UX15 382 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 GANCQ8TET4 914 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 GGA2Q9UJY4 613 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa20.16■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 E7ENQ6 273 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms