RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409205.5

SUMO1-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SUMO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-205	ENST00000409205		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205		J3KTA2	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	FCHO1	O14526	889 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	NPC1	O15118	1278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	MT-CO3	P00414	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	ALPL	P05186	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	NPPB	P16860	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	DGKQ	P52824	942 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	CFHR3	Q02985	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	GGT6	Q6P531	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	RITA1	Q96K30	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	TAF5L	O75529	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	ANXA6	P08133	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	ITGA5	P08648	1049 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	DRD1	P21728	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	GRM4	Q14833	912 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205		M0QZQ0	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	ASNA1	O43681	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	MT3	P25713	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	ICA1	Q05084	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	ZACN	Q401N2	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUMO1-205	ENST00000409205	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	SYT5	O00445	386 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	KRT86	O43790	486 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	USP1	O94782	785 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	PRF1	P14222	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	KLRK1	P26718	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	GALNS	P34059	522 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	SERPINF1	P36955	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	HYAL1	Q12794	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	KRT81	Q14533	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUMO1-205	ENST00000409205	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms