RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 DESP17661 470 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCB4P21439 1286 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD72P21854 359 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SDC4P31431 198 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FLT3P36888 993 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPN9P43378 593 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAB4Q2WGN9 574 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANO4Q32M45 955 aa15.89■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 BRMS1LQ5PSV4 323 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MPP7Q5T2T1 576 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUDT18Q6ZVK8 323 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAM32Q8TC27 787 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BBS2Q9BXC9 721 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PARVAQ9NVD7 372 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAS2R14Q9NYV8 317 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNU1A8MYU2 1149 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENDOD1O94919 500 aa15.88■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDGFRAP16234 1089 aa15.88■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GALK1P51570 392 aa15.88■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEUP1Q05D60 604 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCINQ13939 588 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PON2Q15165 354 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FYB2Q5VWT5 728 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STRADAQ7RTN6 431 aa15.88■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF34Q969K3 372 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNKPQ96T60 521 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNH6Q9H252 994 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa15.88■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEC1Q9P2X7 70 aa15.88■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PI15O43692 258 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RRM1P23921 792 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRIA2P42262 883 aa15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FZD5Q13467 585 aa15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR59Q6PJI9 974 aa15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBCBQ99426 244 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHRDQ9H2X0 955 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEF6Q9H4E7 631 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDCPQ9H6R7 721 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXO10Q9UK96 956 aa15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC14Q49A88 953 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIK3R6Q5UE93 754 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF43Q68DV7 783 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRAMD4Q6IC98 578 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRNP1Q6NT89 227 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EMC1Q8N766 993 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FNIP1Q8TF40 1166 aa15.86■□□□□ 0.13
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