RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCLYQ96I15 445 aa13.47□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 C9orf72Q96LT7 481 aa13.47□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa13.47□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.47□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 BRD8Q9H0E9 1235 aa13.47□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 VPS37BQ9H9H4 285 aa13.47□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 USP29Q9HBJ7 922 aa13.47□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 COMMD8Q9NX08 183 aa13.47□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 CARNS1A5YM72 827 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 C5orf60A6NFR6 353 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 TNFRSF10BO14763 440 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDH16O75309 829 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 GCATO75600 419 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 DGKIO75912 1065 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 FDFT1P37268 417 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 GATMP50440 423 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATP1A2P50993 1020 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 GNGT1P63211 74 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 SARNPP82979 210 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 TLE2Q04725 743 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAAP100Q0VG06 881 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 DPYSQ14117 519 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 KCNJ11Q14654 390 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIM60Q495X7 471 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 TAC4Q86UU9 113 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADAM32Q8TC27 787 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 PYROXD1Q8WU10 500 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 HTR3CQ8WXA8 447 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 PWWP2AQ96N64 755 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 SERPINB11Q96P15 392 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 OLFM3Q96PB7 478 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 TKTL2Q9H0I9 626 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMOC2Q9H3U7 446 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 RAB6BQ9NRW1 208 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 ETNK2Q9NVF9 386 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 MARCH5Q9NX47 278 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 DTLQ9NZJ0 730 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCML2Q9UQR0 700 aa13.46□□□□□ -0.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 E7ESA3 106 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 E7EVH7 732 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 GOLGA8MH3BSY2 632 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 IRAK2O43187 625 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 MTSS1O43312 755 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 MFSD11O43934 449 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPAG6O75602 509 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 GALTP07902 379 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC2A3P11169 496 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 TPSB2P20231 275 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 MX2P20592 715 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 MDH1P40925 334 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLCO1A2P46721 670 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 PSEN1P49768 467 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 NR1H3Q13133 447 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 SEMA3BQ13214 749 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 AUHQ13825 339 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 TPSAB1Q15661 275 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 LONRF1Q17RB8 773 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 KLHL38Q2WGJ6 581 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 BBS9Q3SYG4 887 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANKRD22Q5VYY1 191 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEFB128Q7Z7B8 93 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 MON1AQ86VX9 555 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTPALQ9BTX7 342 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 OSBPL2Q9H1P3 480 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 LGALS13Q9UHV8 139 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 LTBP2Q14767 1821 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A0A0MRY4 1105 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCLK1O15075 740 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 OPHN1O60890 802 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM63AO94886 807 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGLV3-25P01717 112 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 ERCC2P18074 760 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCR1P32246 355 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAGEA6P43360 314 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 GLUD2P49448 558 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARPP19P56211 112 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 COG7P83436 770 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 GPR17Q13304 367 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP2R5DQ14738 602 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC38Q502W7 563 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 PALM2Q8IXS6 379 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 MCUQ8NE86 351 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 TET1Q8NFU7 2136 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCAMP5Q8TAC9 235 aa13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms