RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375541.9

CROCC-201, Transcript of ciliary rootlet coiled-coil, rootletin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CROCC, Length 6,656 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC-201ENST00000375541 SH3BP4Q9P0V3 963 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 TBCELQ5QJ74 424 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 O00370 1275 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 ATP6V1G2O95670 118 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 FAM83EQ2M2I3 478 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 AGKQ53H12 422 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 EFHC1Q5JVL4 640 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 PLA2G6O60733 806 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 EGFRP00533 1210 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 RRM1P23921 792 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CEBPGP53567 150 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 NCF4Q15080 339 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 IQCF2Q8IXL9 164 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 DEFB107AQ8IZN7 70 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 LRRC39Q96DD0 335 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 TMEM169Q96HH4 297 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 C2orf81A6NN90 581 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 FAM25EA8MYX2 175 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 PCSK1P29120 753 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 SERPINB9P50453 376 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 PUDPQ08623 228 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 RASA2Q15283 850 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CACHD1Q5VU97 1274 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 ZNF438Q7Z4V0 828 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 TAF8Q7Z7C8 310 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 DPP10Q8N608 796 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CPT1AP50416 773 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 HIC2Q96JB3 615 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 USP18Q9UMW8 372 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 PSTPIP1O43586 416 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 SLFN11Q7Z7L1 901 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 TADA1Q96BN2 335 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 KCND2Q9NZV8 630 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 WDR35Q9P2L0 1181 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 USP12O75317 370 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 HBP1O60381 514 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 UMPSP11172 480 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CCDC130P13994 396 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CYP11B2P19099 503 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 ITGADQ13349 1161 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 PTK6Q13882 451 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 SPPL2AQ8TCT8 520 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 PIGKQ92643 395 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 ISCUQ9H1K1 167 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 MAGEB2O15479 319 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 PSMD3O43242 534 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 BUD23O43709 281 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 ZMPSTE24O75844 475 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CLPTM1O96005 669 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 ICAM1P05362 532 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 NPTX2P47972 431 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 HERVK_113P62684 666 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 GRIK3Q13003 919 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 MAP3K14Q99558 947 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.93■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 CYP11B1P15538 503 aa15.92■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 MAGP20916 626 aa15.92■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.92■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.92■□□□□ 0.14
CROCC-201ENST00000375541 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms