RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KATNBL1Q9H079 304 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ABCB8Q9NUT2 735 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 APEX2Q9UBZ4 518 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM10Q9UDY6 481 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 NDOR1Q9UHB4 597 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRFP10586 1907 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DCDC2BA2VCK2 349 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 C1RP00736 705 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TYRP14679 529 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 NOS2P35228 1153 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 AMZ1Q400G9 498 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 MEI1Q5TIA1 1274 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TTI2Q6NXR4 508 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SLC43A3Q8NBI5 491 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ATL2Q8NHH9 583 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZBP1Q9H171 429 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN12O43309 604 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 TFDP2Q14188 446 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 CEP104O60308 925 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HSF2BPO75031 334 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 JMJD7P0C870 316 aa4.59□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 AKT2P31751 481 aa4.59□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 ID4P47928 161 aa4.59□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 SULT2A1Q06520 285 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 UPP1Q16831 310 aa4.59□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 SARM1Q6SZW1 724 aa4.59□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.59□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SERAC1Q96JX3 654 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HSPA12BQ96MM6 686 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LRFN3Q9BTN0 628 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TKTL2Q9H0I9 626 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LHX5Q9H2C1 402 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00597Q9H2U6 94 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ASIC3Q9UHC3 531 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ERVW-1Q9UQF0 538 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 H3BM21 787 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RASGRP1O95267 797 aa4.58□□□□□ -1.68
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