RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 DNM1LO00429 736 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 LTFP02788 710 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 PTK7Q13308 1070 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 SEMA5AQ13591 1074 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 ITGA7Q13683 1181 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 DPYSQ14117 519 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 RFX8Q6ZV50 586 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 BHLHA9Q7RTU4 235 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 KDM4CQ9H3R0 1056 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 A0A0A0MRY4 1105 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 FAM72CH0Y354 149 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 I6L893 689 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 C1QAP02745 245 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 AMHP03971 560 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 GRIK3Q13003 919 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 FAM72AQ5TYM5 149 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 FAM72DQ6L9T8 149 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 FAM171BQ6P995 826 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 FAM72BQ86X60 149 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 METTL23Q86XA0 190 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 PGBD4Q96DM1 585 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 SPATA13Q96N96 652 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 ACBD6Q9BR61 282 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 CEP350Q5VT06 3117 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 CPP00450 1065 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 CYP11A1P05108 521 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 AP1B1Q10567 949 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 TUSC3Q13454 348 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 CGB2Q6NT52 195 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 NTAN1Q96AB6 310 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 LRRC39Q96DD0 335 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 IKBKGQ9Y6K9 419 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA8RI6L899 631 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 INHBAP08476 426 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 BDNFP23560 247 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 GRIA1P42261 906 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 AIF1P55008 147 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 SPATA21Q7Z572 469 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 EDEM1Q92611 657 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 P2RY11Q96G91 374 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 SIGLEC10Q96LC7 697 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 DDIT4Q9NX09 232 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 F5H423 210 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 ZWINTO95229 277 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 SCAPQ12770 1279 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 FAM26DQ5JW98 314 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 MPP5Q8N3R9 675 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 M0QZQ0 153 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 RNF103O00237 685 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 DCLK1O15075 740 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 SUN1O94901 812 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 ITGB1P05556 798 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 GLUD2P49448 558 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 FAAP100Q0VG06 881 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 SEMA3BQ13214 749 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 PDK1Q15118 436 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 MTFR1Q15390 333 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 LVRNQ6Q4G3 990 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 TP53INP2Q8IXH6 220 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 BANPQ8N9N5 519 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 SPOCK2Q92563 424 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 TMEM209Q96SK2 561 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 PKMYT1Q99640 499 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.59■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 F8W810 466 aa23.59■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 YY1P25490 414 aa23.59■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 DNAJC3Q13217 504 aa23.59■■□□□ 1.37
SNX18-201ENST00000326277 PDK4Q16654 411 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms