RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 FAM47EQ6ZV65 393 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF534Q76KX8 674 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 RNF169Q8NCN4 708 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL14Q9P2G3 628 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FAAP100Q0VG06 881 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PDK1Q15118 436 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 KCNA10Q16322 511 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC6Q86X45 466 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 NTAN1Q96AB6 310 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SLC12A4Q9UP95 1085 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 MGEA5O60502 916 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 C1QAP02745 245 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 USP17L7P0C7H9 530 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PRKCHP24723 683 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ADRA1BP35368 520 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CACNA2D1P54289 1103 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 RFX8Q6ZV50 586 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.45■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 A0A0U1RQF3 1178 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 GOLGA8RI6L899 631 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 POMCP01189 267 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 APOEP02649 317 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 NCAM1P13591 858 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 GLUD2P49448 558 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CDK16Q00536 496 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PRKCZQ05513 592 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 AP1B1Q10567 949 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 DPYSQ14117 519 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 METTL23Q86XA0 190 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PPM1NQ8N819 430 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ZIC5Q96T25 663 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 RRN3Q9NYV6 651 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.44■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 OPHN1O60890 802 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 B3GAT3O94766 335 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 LTFP02788 710 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SCAPQ12770 1279 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ADAM32Q8TC27 787 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SPOCK2Q92563 424 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 P2RY11Q96G91 374 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ACBD6Q9BR61 282 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 HHLA1C9JL84 531 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 DSC3Q14574 896 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 RNF43Q68DV7 783 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CCNYQ8ND76 341 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 MYLPFQ96A32 169 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PGBD4Q96DM1 585 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SERAC1Q96JX3 654 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.43■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 RNF103O00237 685 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 DCLK1O15075 740 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 LPXNO60711 386 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ADRA1DP25100 572 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SLC18A2Q05940 514 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SLC20A2Q08357 652 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 LGSNQ5TDP6 509 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC63Q8NA47 563 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 TSC2P49815 1807 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 I3L4J1 428 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 EDF1O60869 148 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 KRT37O76014 449 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 MLNP12872 115 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 GRIK3Q13003 919 aa22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms