RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 APOL5Q9BWW9 433 aa28.44■■■□□ 2.14
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SOBPA7XYQ1 873 aa28.43■■■□□ 2.14
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A12Q96S37 553 aa28.42■■■□□ 2.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC46A2Q9BY10 475 aa28.42■■■□□ 2.14
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CEBPBP17676 345 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMRN1Q13201 1228 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 TFDP2Q14188 446 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTC16Q8NEE8 873 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGEB5Q9BZ81 275 aa28.38■■■□□ 2.13
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