RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 CDK17Q00537 523 aa26.48■■□□□ 1.83
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CTXN1-201ENST00000318978 CRY1Q16526 586 aa26.48■■□□□ 1.83
CTXN1-201ENST00000318978 FILIP1LQ4L180 1135 aa26.48■■□□□ 1.83
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CTXN1-201ENST00000318978 ERICH1Q86X53 443 aa26.48■■□□□ 1.83
CTXN1-201ENST00000318978 DEFB106AQ8N104 65 aa26.48■■□□□ 1.83
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CTXN1-201ENST00000318978 ASNSD1Q9NWL6 643 aa26.48■■□□□ 1.83
CTXN1-201ENST00000318978 STOML2Q9UJZ1 356 aa26.48■■□□□ 1.83
CTXN1-201ENST00000318978 FBXO10Q9UK96 956 aa26.48■■□□□ 1.83
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CTXN1-201ENST00000318978 COX16Q9P0S2 106 aa26.47■■□□□ 1.83
CTXN1-201ENST00000318978 STARD13Q9Y3M8 1113 aa26.47■■□□□ 1.83
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CTXN1-201ENST00000318978 TMEM92Q6UXU6 159 aa26.46■■□□□ 1.83
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CTXN1-201ENST00000318978 ZNF677Q86XU0 584 aa26.46■■□□□ 1.83
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CTXN1-201ENST00000318978 SLC20A1Q8WUM9 679 aa26.46■■□□□ 1.83
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CTXN1-201ENST00000318978 AZIN2Q96A70 460 aa26.46■■□□□ 1.83
CTXN1-201ENST00000318978 SLC2A11Q9BYW1 496 aa26.46■■□□□ 1.83
CTXN1-201ENST00000318978 TPSD1Q9BZJ3 242 aa26.46■■□□□ 1.83
CTXN1-201ENST00000318978 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
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CTXN1-201ENST00000318978 ARID5AQ03989 594 aa26.45■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 GEN1Q17RS7 908 aa26.45■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
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CTXN1-201ENST00000318978 PGBD3Q8N328 593 aa26.45■■□□□ 1.82
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CTXN1-201ENST00000318978 SLC39A13Q96H72 371 aa26.45■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 SLC2A13Q96QE2 648 aa26.45■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 DDIT4Q9NX09 232 aa26.45■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 EBF1Q9UH73 591 aa26.45■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa26.45■■□□□ 1.82
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CTXN1-201ENST00000318978 DAB1O75553 588 aa26.44■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 HOXB2P14652 356 aa26.44■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 SLC6A4P31645 630 aa26.44■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 SGSHP51688 502 aa26.44■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
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CTXN1-201ENST00000318978 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
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CTXN1-201ENST00000318978 SLC26A9Q7LBE3 791 aa26.44■■□□□ 1.82
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CTXN1-201ENST00000318978 STIM2Q9P246 746 aa26.44■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa26.43■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 TEX33O43247 280 aa26.43■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 SERPINC1P01008 464 aa26.43■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 NME3Q13232 169 aa26.43■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 IQCB1Q15051 598 aa26.43■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 PIK3R6Q5UE93 754 aa26.43■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 LAIR1Q6GTX8 287 aa26.43■■□□□ 1.82
CTXN1-201ENST00000318978 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa26.43■■□□□ 1.82
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