RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A13Q9UJS0 675 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ENDOD1O94919 500 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ITPK1Q13572 414 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM48Q8IWZ4 208 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRE3Q9BY15 652 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 MRASO14807 208 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ASNA1O43681 348 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DDHD2O94830 711 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SDE2Q6IQ49 451 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CREG2Q8IUH2 290 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PXMP2Q9NR77 195 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SPACA6W5XKT8 324 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CRABP2P29373 138 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 LDLRP01130 860 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 FAAP100Q0VG06 881 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMA4DQ92854 862 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTR8Q9H981 624 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC154A6NI56 674 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR182O15218 404 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ST13P50502 369 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 COX10Q12887 443 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TTMPQ5BVD1 217 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM8Q9BZR9 551 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CYLDQ9NQC7 956 aa24.73■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ME2P23368 584 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 THPOP40225 353 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SOX10P56693 466 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 RHOAP61586 193 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 HDHD2Q9H0R4 259 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 HACL1Q9UJ83 578 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 RHOCP08134 193 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 LHX1P48742 406 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CCL15Q16663 113 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX32Q86XE0 403 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 HTR3CQ8WXA8 447 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 OPTNQ96CV9 577 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 GMCL1Q96IK5 515 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PARVBQ9HBI1 364 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH1A2O94788 518 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CXCL8P10145 99 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF148Q8N7C7 305 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A096LPK6 155 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.556e-8■■■■■ 35.7
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GNPTAB-201ENST00000299314 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ILDR2Q71H61 639 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 HOMEZQ8IX15 550 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF614Q8N883 585 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPC4APQ8TEL6 797 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.72■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 UBXN8O00124 270 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 STYK1Q6J9G0 422 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2R1Q6VVX0 501 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC149Q6ZUS6 474 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CDRT15Q96T59 188 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 MID1IP1Q9NPA3 183 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC12A8A0AV02 714 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM114B3SHH9 223 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 KATNA1O75449 491 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMG1O95456 288 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 EGFRP00533 1210 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 BTBD7Q9P203 1132 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DNPEPQ9ULA0 475 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM220BPB1ANY3 271 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 HS6ST1O60243 411 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DGKKQ5KSL6 1271 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 FNDC5Q8NAU1 212 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SERHL2Q9H4I8 314 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SERHLQ9NQF3 203 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CNGB3Q9NQW8 809 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 XRCC4Q13426 336 aa24.71■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
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