RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TCEA3O75764 348 aa23.53■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 VAV1P15498 845 aa23.53■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TLE2Q04725 743 aa23.53■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 LEKR1Q6ZMV7 388 aa23.53■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SMAPO00193 183 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 DCLK1O15075 740 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CXCL10P02778 98 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 STAT4Q14765 748 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SCD5Q86SK9 330 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TP53INP2Q8IXH6 220 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 VPS37BQ9H9H4 285 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PATJQ8NI35 1801 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 E7ESA3 106 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CHADO15335 359 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ERCC2P18074 760 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ARPP19P56211 112 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 GPX6P59796 221 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 BBS9Q3SYG4 887 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PDIK1LQ8N165 341 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PHACTR1Q9C0D0 580 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 RABEP2Q9H5N1 569 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 NMUR1Q9HB89 426 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 VWA8A3KMH1 1905 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CLUHO75153 1309 aa23.52■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TTC3P53804 2025 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 FOXO6A8MYZ6 492 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 GCATO75600 419 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 METTL18O95568 372 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV3-25P01717 112 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 GALTP07902 379 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 FGFR3P22607 806 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TPI1P60174 286 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 FUT10Q6P4F1 479 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 BEND5Q7L4P6 421 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO36Q8NEA4 188 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 MDM1Q8TC05 714 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 PYROXD1Q8WU10 500 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 HTR3CQ8WXA8 447 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 RNF34Q969K3 372 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC77Q9BR77 488 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 A6NNZ2 444 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 HOXA2O43364 376 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TUBB8Q3ZCM7 444 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF280DQ6N043 979 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC3L1Q86VI1 746 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CYP4X1Q8N118 509 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 KLC2Q9H0B6 622 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TBK1Q9UHD2 729 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT5Q9UKK9 219 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa23.51■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 C5orf60A6NFR6 353 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 HACD1B0YJ81 288 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 IVLP07476 585 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SSTR1P30872 391 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 LSP1P33241 339 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 RTP2Q5QGT7 225 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 VSTM1Q6UX27 236 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SELENOSQ9BQE4 189 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 OR12D3Q9UGF7 316 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PQH9 124 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 AVILO75366 819 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 UPP2O95045 317 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 APRTP07741 180 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 GCAP28676 217 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 MMP13P45452 471 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 AP1B1Q10567 949 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 NUP93Q8N1F7 819 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 GPR152Q8TDT2 470 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CASP10Q92851 521 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 C8orf48Q96LL4 319 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.5■■□□□ 1.35
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