RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.76■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COCHO43405 550 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HMBSP08397 361 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KDELR1P24390 212 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GABRR2P28476 465 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GGCXP38435 758 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCR2P41597 374 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CXCR3P49682 368 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARSEP51690 589 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNX30Q5VWJ9 437 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KAZNQ674X7 775 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCTD6Q8NC69 237 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDZD8Q8NEN9 1154 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OVCA2Q8WZ82 227 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEC14L1Q92503 715 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF38Q9H0F5 515 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC19Q9H756 370 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NFU1Q9UMS0 254 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ASB3Q9Y575 518 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COILP38432 576 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTGIRP43119 386 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDH6P55285 790 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM193AP78312 1265 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NTHL1P78549 312 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAVIN3Q969G5 261 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF34Q969K3 372 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC22A12Q96S37 553 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OSBPL8Q9BZF1 889 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAB17Q9H0T7 212 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDCPQ9H6R7 721 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MARCH2Q9P0N8 246 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EYSQ5T1H1 3165 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYL4P12829 197 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FNTAP49354 379 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COPS2P61201 443 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NNTQ13423 1086 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRADDQ15628 312 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BOLA3Q53S33 107 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STXBP5Q5T5C0 1151 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TXNDC8Q6A555 127 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TEKT4Q8WW24 435 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP2S1Q96SQ9 504 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CALN1Q9BXU9 219 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A1W2PRU2 124 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADRA1BP35368 520 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDKN2BP42772 138 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HECTD3Q5T447 861 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTC27Q6P3X3 843 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELMOD1Q8N336 334 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCEAL4Q96EI5 215 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRPC7Q9HCX4 862 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOTCH4Q99466 2003 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DENND4CQ5VZ89 1909 aa24.73■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC12A8A0AV02 714 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM72CH0Y354 149 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LINC01565O15544 149 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 F9P00740 461 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IL4RP24394 825 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 L1CAMP32004 1257 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GBP1P32455 592 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNC3Q14003 757 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DPYSL3Q14195 570 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ODF2Q5BJF6 829 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCEAL5Q5H9L2 206 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM72AQ5TYM5 149 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM72DQ6L9T8 149 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM72BQ86X60 149 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 JAMLQ86YT9 394 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SERPINB11Q96P15 392 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERP44Q9BS26 406 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OAS1P00973 400 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT81Q14533 505 aa24.72■■□□□ 1.55
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