RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 DLGAP3O95886 979 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KRT6AP02538 564 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KRT6BP04259 564 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 EPB42P16452 691 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KRT6CP48668 564 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF280DQ6N043 979 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 LUZP2Q86TE4 346 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM79Q9BSE2 394 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 VPS28Q9UK41 221 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 WDR27A2RRH5 827 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 GPC1P35052 558 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CDK16Q00536 496 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4Z1Q86W10 505 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MAML3Q96JK9 1138 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 VAT1Q99536 393 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM114B3SHH9 223 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FSBPO95073 299 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 HMGCRP04035 888 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 INSRRP14616 1297 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FCGRTP55899 365 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SREBF2Q12772 1141 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 OOSP2Q86WS3 158 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 NSMCE2Q96MF7 247 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 CATSPER2Q96P56 530 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ACTR8Q9H981 624 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KRT84Q9NSB2 600 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 STARD13Q9Y3M8 1113 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 MICAL2O94851 1124 aa21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 KRT78Q8N1N4 520 aa21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 BDH2Q9BUT1 245 aa21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 YIPF2Q9BWQ6 316 aa21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-201ENST00000284617 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 GRIN3BO60391 1043 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CCT8P50990 548 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SLC15A2Q16348 729 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 NMRAL1Q9HBL8 299 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf41Q9Y2V0 281 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF682O95780 498 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MGAT1P26572 445 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 KRT20P35900 424 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CBWD6Q4V339 395 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf96Q7Z7L8 435 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PGBD3Q8N328 593 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 FAM136AQ96C01 138 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM51Q9NW97 253 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 DYRK1BQ9Y463 629 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 C2CD2LO14523 706 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PGS1Q32NB8 556 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 DHFR2Q86XF0 187 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 BHMTQ93088 406 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A13Q9UJS0 675 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CKMP06732 381 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ME2P23368 584 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PSMA3P25788 255 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MIPP30301 263 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TRAF2Q12933 501 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 OSMRQ99650 979 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SPACA6W5XKT8 324 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 FAAP100Q0VG06 881 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 STK32AQ8WU08 396 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PARVBQ9HBI1 364 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CHST7Q9NS84 486 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF839A8K0R7 811 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 KPNA6O60684 536 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CCNG1P51959 295 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A3Q01959 620 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF662Q6ZS27 426 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PRRG3Q9BZD7 231 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MYLK2Q9H1R3 596 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SNTG2Q9NY99 539 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFAF1Q9Y375 327 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ADIGQ0VDE8 80 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 WDR59Q6PJI9 974 aa21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms