RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284483.12

TNIK-201, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIK, Length 4,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-201ENST00000284483 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 AP4S1Q9Y587 144 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 KAT6AQ92794 2004 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 H0Y626 953 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 C2CD2LO14523 706 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ADAMTS3O15072 1205 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TRIM16O95361 564 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 RALBP11234 206 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ALDH1A3P47895 512 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 PLD3Q8IV08 490 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 LZTR1Q8N653 840 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CALML6Q8TD86 181 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 JADE3Q92613 823 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 HPS1Q92902 700 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ART4Q93070 314 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TMEM143Q96AN5 459 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 PLEKHA8Q96JA3 519 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 DSEQ9UL01 958 aa9.5□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 APOL1O14791 398 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ITM2AO43736 263 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ICMTO60725 284 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 MFN2O95140 757 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ZNF23P17027 643 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CES1P23141 567 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ETFBP38117 255 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 DLG4P78352 724 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 INPP5AQ14642 412 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ITIH5Q86UX2 942 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 GIPC2Q8TF65 315 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 MED30Q96HR3 178 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TCF12Q99081 682 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 LRRC4Q9HBW1 653 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CRYZL1O95825 349 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 PEX2P28328 305 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 BFSP2Q13515 415 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CARTPTQ16568 116 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CCDC58Q4VC31 144 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TFDP3Q5H9I0 405 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 C4orf22Q6V702 233 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CPNE8Q86YQ8 564 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 WRNIP1Q96S55 665 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CDYLQ9Y232 598 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ALBP02768 609 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 THRAP10827 490 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 GFAPP14136 432 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 IFNA8P32881 189 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ETV3P41162 512 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TLR1Q15399 786 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TTC23LQ6PF05 361 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 SV2AQ7L0J3 742 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 LILRB4Q8NHJ6 448 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 WNK4Q96J92 1243 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 APOL2Q9BQE5 337 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CEP41Q9BYV8 373 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.49□□□□□ -0.89
TNIK-201ENST00000284483 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms