RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278064.6

CFAP43-201, Transcript of cilia and flagella associated protein 43, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CFAP43, Length 2,963 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP43-201ENST00000278064 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.58□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 CFAP69A5D8W1 941 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 MDM4O15151 490 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SEPT4O43236 478 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SPAG6O75602 509 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SREBF2Q12772 1141 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SETDB1Q15047 1291 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 GPR152Q8TDT2 470 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 C10orf82Q8WW14 230 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 DUSP16Q9BY84 665 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 PIGVQ9NUD9 493 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 CDH23Q9H251 3354 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 KCNK1O00180 336 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 KRT16P08779 473 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ALADP13716 330 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 AP1B1Q10567 949 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 PTK7Q13308 1070 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SERINC5Q86VE9 423 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 STK32AQ8WU08 396 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SMOQ99835 787 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ZNF670Q9BS34 389 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.58□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 B4GALT3O60512 393 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SLC8A3P57103 927 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ERP27Q96DN0 273 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 AGAP3Q96P47 875 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 VPS11Q9H270 941 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 CCDC78A2IDD5 438 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 I6L893 689 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ADAMTS4O75173 837 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 DCTN3O75935 186 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 MT-ND3P03897 115 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 FAM200BP0CF97 657 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 PBX3P40426 434 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 PNPLA4P41247 253 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 MAGEA6P43360 314 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 PGFP49763 221 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ITGA7Q13683 1181 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 CEP57Q86XR8 500 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SIK2Q9H0K1 926 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 HCSTQ9UBK5 93 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.57□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ZNF487B1APH4 448 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 USP12O75317 370 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 C1QAP02745 245 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ALDH3A1P30838 453 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ARPP19P56211 112 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SNX16P57768 344 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 FAAP100Q0VG06 881 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 LPIN1Q14693 890 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 MPP5Q8N3R9 675 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SERAC1Q96JX3 654 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 UGT1A9O60656 530 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 ATP5HO75947 161 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 INHBAP08476 426 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 DESP17661 470 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 INHBEP58166 350 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 SLC18A2Q05940 514 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 DEUP1Q05D60 604 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 XKR4Q5GH76 650 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 CES3Q6UWW8 571 aa14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CFAP43-201ENST00000278064 KLC2Q9H0B6 622 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms