RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ASB16Q96NS5 453 aa11.27□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.27□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 EHD2Q9NZN4 543 aa11.27□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.27□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 CREB3O43889 395 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 GLI1P08151 1106 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 LAMP2P13473 410 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PSEN1P49768 467 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 RAP1GAP2Q684P5 730 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 NADSYN1Q6IA69 706 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SCML4Q8N228 414 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SUSD6Q92537 303 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 RAPGEF5Q92565 580 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 VANGL2Q9ULK5 521 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 COL4A3Q01955 1670 aa11.27□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ZNF197O14709 1029 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 GREM1O60565 184 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 OLFM2O95897 454 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 RARAP10276 462 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SLC6A4P31645 630 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PTPN9P43378 593 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PIK3R6Q5UE93 754 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PEX26Q7Z412 305 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 C14orf80Q86SX3 495 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 OVCA2Q8WZ82 227 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CEP295NLQ96MC4 621 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 RIPOR3Q96MK2 946 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SERPINB11Q96P15 392 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 FAM118BQ9BPY3 351 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ASNSD1Q9NWL6 643 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 MPP6Q9NZW5 540 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CDH7Q9ULB5 785 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 NUMBLQ9Y6R0 609 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 NUP205Q92621 2012 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ANTXRLA6NF34 631 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 TRIM24O15164 1050 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ZNF185O15231 689 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PRPSAP2O60256 369 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PAGE1O75459 146 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 FCARP24071 287 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CCR1P32246 355 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ADCY2Q08462 1091 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 IER5LQ5T953 404 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 BNIPLQ7Z465 357 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ZSCAN30Q86W11 494 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 FNIP1Q8TF40 1166 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 EBF3Q9H4W6 596 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 DNAI1Q9UI46 699 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 TLR6Q9Y2C9 796 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CLGNO14967 610 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 MTA2O94776 668 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 KRT10P13645 584 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 WEE1P30291 646 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SCNN1AP37088 669 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 KAZNQ674X7 775 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 MSANTD2Q6P1R3 559 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 VITQ6UXI7 678 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 TP53INP2Q8IXH6 220 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SLC39A13Q96H72 371 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 HEMGNQ9BXL5 484 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CALN1Q9BXU9 219 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 HS3ST4Q9Y661 456 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 LRRD1A4D1F6 860 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 DPYSL4O14531 572 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms