RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ADAM22Q9P0K1 906 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 WDR35Q9P2L0 1181 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 CLEC4EQ9ULY5 219 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 KCNU1A8MYU2 1149 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ACSL4O60488 711 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 TNFAIP3P21580 790 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A4P31645 630 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 NSFP46459 744 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 LRRC32Q14392 662 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 MYEOVQ96EZ4 313 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 GJB6O95452 261 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SGSHP51688 502 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 DNAAF5Q86Y56 855 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 JOSD2Q8TAC2 188 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 BHMTQ93088 406 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 PRRX2Q99811 253 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 DDIT4Q9NX09 232 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 HCN2Q9UL51 889 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.31e-6■■■■□ 19.7
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN3O60637 253 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 KAT7O95251 611 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 TPM3P06753 285 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ANGPT1Q15389 498 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 PIK3R6Q5UE93 754 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 RNF43Q68DV7 783 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 RFWD3Q6PCD5 774 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 MCOLN2Q8IZK6 566 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 EMC1Q8N766 993 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 TBCBQ99426 244 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 PIGVQ9NUD9 493 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 I6L893 689 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 M0QYT0 321 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 RNF40O75150 1001 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 HOXC13P31276 330 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 GRIA2P42262 883 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SLC11A2P49281 568 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ARID5BQ14865 1188 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A52Q3SY17 297 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 FBXO43Q4G163 708 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SPEM1Q8N4L4 309 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 IER2Q9BTL4 223 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ANLNQ9NQW6 1124 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 RRN3Q9NYV6 651 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 DEC1Q9P2X7 70 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 H0Y858 1186 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 ENDOD1O94919 500 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 CALB1P05937 261 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 GZMAP12544 262 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TDGF1P13385 188 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 GBP1P32455 592 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 KDSRQ06136 332 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R5DQ14738 602 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 MPPE1Q53F39 396 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 RAB6CQ53S08 254 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 EMC10Q5UCC4 262 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 WDR59Q6PJI9 974 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 C3orf20Q8ND61 904 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 EXOC4Q96A65 974 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 RAB6CQ9H0N0 254 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 COX16Q9P0S2 106 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC16A6NMB1 481 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 APODP05090 189 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 SERPING1P05155 500 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 CCR1P32246 355 aa23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.7 ms