RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	TFR2	Q9UP52	801 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	CAPN9	O14815	690 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	WEE1	P30291	646 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	OGDH	Q02218	1023 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	GOLGA1	Q92805	767 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF653	Q96CK0	615 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	MCEE	Q96PE7	176 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	TBCB	Q99426	244 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	THAP2	Q9H0W7	228 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	ISCU	Q9H1K1	167 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634		I6L893	689 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	RTN2	O75298	545 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	IGLV3-25	P01717	112 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	GGCX	P38435	758 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	NME3	Q13232	169 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	C3orf20	Q8ND61	904 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	BRD9	Q9H8M2	597 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	CA14	Q9ULX7	337 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SCARB2-222	ENST00000640634	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	IRAK2	O43187	625 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	AKR1B10	O60218	316 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CALB1	P05937	261 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	GZMA	P12544	262 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PFKL	P17858	780 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CD72	P21854	359 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	MATK	P42679	507 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	SULT1E1	P49888	294 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	GALC	P54803	685 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ATP11A	P98196	1134 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC18A3	Q16572	532 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CDO1	Q16878	200 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	EML3	Q32P44	896 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634		Q6ZNB5	142 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	DENND1C	Q8IV53	801 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	YAF2	Q8IY57	180 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	BHMT	Q93088	406 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	NPY6R	Q99463	290 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	DEF6	Q9H4E7	631 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PIGV	Q9NUD9	493 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.39	□□□□□ -0.59

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