RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC43Q8N309 656 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SHC3Q92529 594 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RUBCNLQ9H714 662 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC78A2IDD5 438 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 VPS4BO75351 444 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ITGAVP06756 1048 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ABHD2P08910 425 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CKBP12277 381 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MIPP30301 263 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CENPTQ96BT3 561 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ASB2Q96Q27 587 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 THTPAQ9BU02 230 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CLPBQ9H078 707 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ACOT9Q9Y305 439 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 STK25O00506 426 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 IRF6O14896 467 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RAMP2O60895 175 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 POMCP01189 267 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 BMP6P22004 513 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GP5P40197 560 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB106AQ8N104 65 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MREGQ8N565 214 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TEKT4Q8WW24 435 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 WNK4Q96J92 1243 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 APOL5Q9BWW9 433 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NT5MQ9NPB1 228 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 VPS28Q9UK41 221 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 EVPLLA8MZ36 301 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 AIM2O14862 343 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LTFP02788 710 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TPBGLP0DKB5 382 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC130P13994 396 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CPA3P15088 417 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PPP3CCP48454 512 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MIB1Q86YT6 1006 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC19Q9H756 370 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 AKAP10O43572 662 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 JCHAINP01591 159 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINF2P08697 491 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NPR3P17342 541 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 AVPR1AP37288 418 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CD151P48509 253 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SEC24CP53992 1094 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DPYSL3Q14195 570 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF284Q2VY69 593 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RRM2BQ7LG56 351 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 WNT8BQ93098 351 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CDT1Q9H211 546 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LHX5Q9H2C1 402 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SELENONQ9NZV5 590 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GGT7Q9UJ14 662 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.63□□□□□ -1.35
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