RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 CSRP2Q16527 193 aa22.68■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 PLK5Q496M5 336 aa22.68■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 FYB2Q5VWT5 728 aa22.68■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.68■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 SPACA7Q96KW9 195 aa22.68■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.68■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 CAPN9O14815 690 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 ZNF445P59923 1031 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 PTK2Q05397 1052 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 MPPE1Q53F39 396 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 STK32AQ8WU08 396 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 SHC3Q92529 594 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 ACP6Q9NPH0 428 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.67■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 PRRT4C9JH25 899 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 TSPAN3O60637 253 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 EPN2O95208 641 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 LATS1O95835 1130 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 CISD3P0C7P0 127 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 TGM1P22735 817 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 SLC11A2P49281 568 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 TBX4P57082 545 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.221e-8■□□□□ 11.3
NME4-211ENST00000620944 ADGRF1Q5T601 910 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 UCMAQ8WVF2 138 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 BECN2A8MW95 431 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 MAP3K13O43283 966 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 TPM2P07951 284 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 E2F5Q15329 346 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 FAM217AQ8IXS0 508 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 GPT2Q8TD30 523 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 SERPINB11Q96P15 392 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 NOX5Q96PH1 765 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 FBXO10Q9UK96 956 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.65■■□□□ 1.22
NME4-211ENST00000620944 E5RJQ4 531 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 KRT9P35527 623 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 CREB5Q02930 508 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 ARID5AQ03989 594 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 PDCLQ13371 301 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 CCDC6Q16204 474 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 MIIPQ5JXC2 388 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 PASD1Q8IV76 773 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 ACOX2Q99424 681 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 SIX2Q9NPC8 291 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 CEP83Q9Y592 693 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.64■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 MPLP40238 635 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 SNX16P57768 344 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 RING1Q06587 406 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 STARD3Q14849 445 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 TMEM110Q86TL2 294 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 RLN3Q8WXF3 142 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 P2RY11Q96G91 374 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 CIPCQ9C0C6 399 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 SYNCQ9H7C4 482 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 STOML2Q9UJZ1 356 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 HCN2Q9UL51 889 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.63■■□□□ 1.21
NME4-211ENST00000620944 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms