RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 KRT35Q92764 455 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TIFAQ96CG3 184 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 GMIPQ9P107 970 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.52□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 FAM170AA1A519 330 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.51□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 GRIN2CQ14957 1233 aa8.51□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.51□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 GIPC2Q8TF65 315 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CASP10Q92851 521 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF670Q9BS34 389 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 NMUR1Q9HB89 426 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DDIT4Q9NX09 232 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 USTQ9Y2C2 406 aa8.51□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CEP104O60308 925 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TLR5O60602 858 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TADA3O75528 432 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 RARGP13631 454 aa8.5□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 CDKN2BP42772 138 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SSR1P43307 286 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MARCKSL1P49006 195 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 HCAR3P49019 387 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TERF1P54274 439 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.5□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 HECTD3Q5T447 861 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SPRED2Q7Z698 418 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TMC8Q8IU68 726 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 COG1Q8WTW3 980 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 EDEM1Q92611 657 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 AZIN2Q96A70 460 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PLD4Q96BZ4 506 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 FAF2Q96CS3 445 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SLC39A13Q96H72 371 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 GCNAQ96QF7 691 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 HAPLN3Q96S86 360 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PEBP4Q96S96 227 aa8.5□□□□□ -1.05
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