RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593708.1

USF2-204, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-204ENST00000593708 RABEPKQ7Z6M1 372 aa22.62■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.62■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 DENND1CQ8IV53 801 aa22.62■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.62■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.62■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 TULP2O00295 520 aa22.61■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 OPHN1O60890 802 aa22.61■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 GJB3O75712 270 aa22.61■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 MXI1P50539 228 aa22.61■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 COG7P83436 770 aa22.61■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.61■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.61■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.61■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 LOC400499M0QZD8 3231 aa22.61■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 KCNJ18B7U540 433 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 NDUFS2O75306 463 aa22.6■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 TMEM215Q68D42 235 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.6■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 PRKCHP24723 683 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 CHKAP35790 457 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.59■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 RGL4Q8IZJ4 473 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 DCLK3Q9C098 648 aa22.59■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 RAB20Q9NX57 234 aa22.59■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 A0A1W2PQ64 194 aa22.58■■□□□ 1.21
USF2-204ENST00000593708 SLC12A8A0AV02 714 aa22.58■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 TKTL1P51854 596 aa22.58■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 GPR174Q9BXC1 333 aa22.58■■□□□ 1.21
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USF2-204ENST00000593708 TMEM8BA6NDV4 472 aa22.57■■□□□ 1.2
USF2-204ENST00000593708 ZNF202O95125 648 aa22.57■■□□□ 1.2
USF2-204ENST00000593708 ZBED1O96006 694 aa22.57■■□□□ 1.2
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USF2-204ENST00000593708 TMPRSS6Q8IU80 811 aa22.56■■□□□ 1.2
USF2-204ENST00000593708 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.56■■□□□ 1.2
USF2-204ENST00000593708 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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USF2-204ENST00000593708 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.56■■□□□ 1.2
USF2-204ENST00000593708 SUSD2Q9UGT4 822 aa22.56■■□□□ 1.2
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