RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 FAF2Q96CS3 445 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 MYRFLQ96LU7 910 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 GDF15Q99988 308 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ZNF670Q9BS34 389 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 GBF1Q92538 1859 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 PTGIRP43119 386 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 SCAPQ12770 1279 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 EFHC2Q5JST6 749 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 STIM2Q9P246 746 aa20.45■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 FAM72CH0Y354 149 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 GOT1P17174 413 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 VSNL1P62760 191 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 DR1Q01658 176 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 EFEMP1Q12805 493 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 FAM72BQ86X60 149 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 RAB21Q9UL25 225 aa20.44■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 FNTAP49354 379 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 EPHB3P54753 998 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ERVK-21P61565 698 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 VEPH1Q14D04 833 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 TAF12Q16514 161 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ANKRD7Q92527 254 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 PSMG2Q969U7 264 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 SERPINB11Q96P15 392 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 PBX4Q9BYU1 374 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 CERS4Q9HA82 394 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 CDH23Q9H251 3354 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ZNF487B1APH4 448 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 TLR5O60602 858 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 PLD1Q13393 1074 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 TFDP2Q14188 446 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 TRADDQ15628 312 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 WDR93Q6P2C0 686 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 NPNTQ6UXI9 565 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ACTL9Q8TC94 416 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.43■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 LIASO43766 372 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 CREB3O43889 395 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 APOC2P02655 101 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 CCR1P32246 355 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 GUCY2DQ02846 1103 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 SEMA3BQ13214 749 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 TNS4Q8IZW8 715 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 PLD5Q8N7P1 536 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 SLC39A13Q96H72 371 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 SAMD11Q96NU1 681 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.42■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ESYT3A0FGR9 886 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 H3BNC9 293 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 GLUD1P00367 558 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 AMPD1P23109 780 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ARL4AP40617 200 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 CLCN4P51793 760 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 GPM6BQ13491 265 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 PPP2R5DQ14738 602 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 MIB1Q86YT6 1006 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 JAMLQ86YT9 394 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ATL2Q8NHH9 583 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PGS1-211ENST00000589425 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms