RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PRU2 124 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ESPNB1AK53 854 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ENC1O14682 589 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN12O43309 604 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TBX10O75333 385 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DAB1O75553 588 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LTFP02788 710 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 IRF1P10914 325 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RARGP13631 454 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GPD1P21695 349 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 COMTP21964 271 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SP100P23497 879 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMA2P25787 234 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 YWHAQP27348 245 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GABRR2P28476 465 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ACADSBP45954 432 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 EPHB3P54753 998 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC8A3P57103 927 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GNG11P61952 73 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CREMQ03060 361 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 EFEMP1Q12805 493 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NME3Q13232 169 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TEAD2Q15562 447 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF12Q16514 161 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC14Q49A88 953 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 HS1BP3Q53T59 392 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DCAF6Q58WW2 860 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 AADACL2Q6P093 401 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GAREM2Q75VX8 874 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TAC4Q86UU9 113 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ITFG1Q8TB96 612 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 STK32AQ8WU08 396 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TSC1Q92574 1164 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT35Q92764 455 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CASP10Q92851 521 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA17Q96L03 361 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PEBP4Q96S96 227 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CLDND1Q9NY35 253 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 USP3Q9Y6I4 520 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO7AQ13402 2215 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NOTCH4Q99466 2003 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CARNS1A5YM72 827 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 I6L893 689 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 M0QYT0 321 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CAPN9O14815 690 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 COCHO43405 550 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MOSPD3O75425 235 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO21O94952 628 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 F11P03951 625 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CSH1P0DML2 217 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CSH2P0DML3 217 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MYBL1P10243 752 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NCAM1P13591 858 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PDGFRAP16234 1089 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CEBPBP17676 345 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 AMPD1P23109 780 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGB7P26010 798 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 IL1R2P27930 398 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LTBRP36941 435 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GATA4P43694 442 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NUMBP49757 651 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SMARCB1Q12824 385 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNC3Q14003 757 aa6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 VEPH1Q14D04 833 aa6.29□□□□□ -1.4
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