RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF840PA6NDX5 716 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TLR5O60602 858 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA31D3P0C874 917 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXA9P31269 272 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 IRS1P35568 1242 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 PRELID2Q8N945 189 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TSC1Q92574 1164 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC19Q9H756 370 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 MTMR10Q9NXD2 777 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CD48P09326 243 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT10P13645 584 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL4AP40617 200 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CA9Q16790 459 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf120Q5SQS8 335 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 HECTD3Q5T447 861 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 KAZNQ674X7 775 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC26Q8TAB7 109 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF157Q96PX1 679 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 HAPLN3Q96S86 360 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 HERPUD2Q9BSE4 406 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TKTL2Q9H0I9 626 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 MARCH2Q9P0N8 246 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-206ENST00000588815 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 FNTAP49354 379 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 RING1Q06587 406 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNG2Q16589 344 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 PPM1LQ5SGD2 360 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 C8orf74Q6P047 294 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC39A13Q96H72 371 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT12Q99456 494 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 OSBPL2Q9H1P3 480 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 NR2E1Q9Y466 385 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 IL4RP24394 825 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 EFEMP1Q12805 493 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MAATS1Q7Z4T9 603 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 RFX6Q8HWS3 928 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 DOCK4Q8N1I0 1966 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 DNMT3LQ9UJW3 386 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BRJ5 948 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CST8O60676 142 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMYND10O75800 440 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBBP07437 444 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 HCAR3P49019 387 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TBX4P57082 545 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A17Q8WUG5 538 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 RUBCNQ92622 972 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 PCYOX1Q9UHG3 505 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT5Q9UKK9 219 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 F11P03951 625 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 HTR7P34969 479 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 LLGL1Q15334 1064 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL7Q8IXQ5 586 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 CCSER2Q9H7U1 834 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF19O95750 216 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 APOEP02649 317 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 APOC2P02655 101 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 POU2F2P09086 479 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA3BQ13214 749 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC9A4Q6AI14 798 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 ARNTL2Q8WYA1 636 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 DCLK3Q9C098 648 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MAN1C1Q9NR34 630 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 RASAL2Q9UJF2 1139 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 V9GYY5 206 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 HELZP42694 1942 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNU1A8MYU2 1149 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 MSI1O43347 362 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV3-27P01718 113 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-206ENST00000588815 TGM2P21980 687 aa32.15■■■□□ 2.74
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