RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582348.1

TSPOAP1-AS1-208, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TSPOAP1-AS1, Length 558 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ABCA7Q8IZY2 2146 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 MED7O43513 233 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ALDH1A2O94788 518 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 EPN2O95208 641 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 FYNP06241 537 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 BCKDHBP21953 392 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 LMNB2Q03252 620 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 MEA1Q16626 185 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 VWA3BQ502W6 1294 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 OLIG1Q8TAK6 271 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ERLEC1Q96DZ1 483 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 LOXL4Q96JB6 756 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 FAM81BQ96LP2 452 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 NDST4Q9H3R1 872 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 DNAJC12Q9UKB3 198 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 A0A1W2PQF6 199 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 KCNJ18B7U540 433 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 E5RJQ4 531 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 GFRA2O00451 464 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TSPAN3O60637 253 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 IGLV3-27P01718 113 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CYBBP04839 570 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 HOXB2P14652 356 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 NTSR1P30989 418 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 GBP1P32455 592 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 KCNJ12Q14500 433 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CSRP2Q16527 193 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 GEN1Q17RS7 908 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PRR23CQ6ZRP0 262 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CHPFQ8IZ52 775 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 FRMD1Q8N878 549 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 DDI1Q8WTU0 396 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 STK32AQ8WU08 396 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RLN3Q8WXF3 142 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 GOLGA1Q92805 767 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 FAM149B1Q96BN6 582 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SMOC1Q9H4F8 434 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CD248Q9HCU0 757 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 DLL3Q9NYJ7 618 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TJP2Q9UDY2 1190 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 STOML2Q9UJZ1 356 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa13.39□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PES1O00541 588 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 NCAM1P13591 858 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 GABRG2P18507 467 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ACADSBP45954 432 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SGSHP51688 502 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 KCNMA1Q12791 1236 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PDCLQ13371 301 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ELF2Q15723 593 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TCP11X2Q5H9J9 407 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ADGRF1Q5T601 910 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 KIAA1211LQ6NV74 962 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TMEM110Q86TL2 294 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PASD1Q8IV76 773 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PGBD3Q8N328 593 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 WDTC1Q8N5D0 677 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 GABRG3Q99928 467 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RAD54BQ9Y620 910 aa13.38□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 WASH3PC4AMC7 463 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SART1O43290 800 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 GDF9O60383 454 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RHOBTB1O94844 696 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 LATS1O95835 1130 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SLC6A4P31645 630 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CLCN1P35523 988 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 MPLP40238 635 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 P2RY2P41231 377 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TBX4P57082 545 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ARHGAP8P85298 464 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RING1Q06587 406 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 MPPE1Q53F39 396 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SYPL2Q5VXT5 272 aa13.37□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 NUGGCQ68CJ6 796 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms