RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 FETUBQ9UGM5 382 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 M0QYT0 321 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 TM7SF2O76062 418 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 ZACNQ401N2 412 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 SCARA3Q6AZY7 606 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 USP6NLQ92738 828 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 FAM162AQ96A26 154 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 ABCC6O95255 1503 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRM-205ENST00000577827 DPPA5A6NC42 116 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 A8MUI8 341 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 SUPT3HB4E1H0 165 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 CRABP2P29373 138 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A3Q00325 362 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 GLRA4Q5JXX5 417 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 MRNIPQ6NTE8 343 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 P3H2Q8IVL5 708 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 SLCO2A1Q92959 643 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 RMDN1Q96DB5 314 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF333Q96JL9 665 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 C7orf26Q96N11 449 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 NDNQ99608 321 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 MRIQ9BWK5 157 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 TEX12Q9BXU0 123 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 NMRAL1Q9HBL8 299 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 PIM2Q9P1W9 311 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 COG5Q9UP83 839 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 PEAK1Q9H792 1746 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM114B3SHH9 223 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 CLOCKO15516 846 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 LYPLA2O95372 231 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A27O95847 323 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 ETS1P14921 441 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 TAF6P49848 677 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 RTP1P59025 263 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 PCDHB18PQ96TA0 734 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 BDH2Q9BUT1 245 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 ASB7Q9H672 318 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 ACP6Q9NPH0 428 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 SLC38A7Q9NVC3 462 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 TRHDEQ9UKU6 1024 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 GOLGA8TH3BQL2 631 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 TPBGLP0DKB5 382 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 COX4I1P13073 169 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 RPL14P50914 215 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 SLC18A1P54219 525 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 RAD23AP54725 363 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 DAB2P98082 770 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 CDH17Q12864 832 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 LIN52Q52LA3 116 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 ZDHHC24Q6UX98 284 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 SLC13A4Q9UKG4 626 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 VAV3Q9UKW4 847 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 ITGA11Q9UKX5 1188 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PPM1 405 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 WDR27A2RRH5 827 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 RGSL1A5PLK6 1076 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 TISP43B9A030 160 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 FBXO21O94952 628 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 RBL1P28749 1068 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 GABRB2P47870 512 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 GLRBP48167 497 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 C21orf59P57076 290 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 SNX17Q15036 470 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 RICTORQ6R327 1708 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 CAMK1DQ8IU85 385 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 AGBL3Q8NEM8 1001 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 MFSD14AQ96MC6 490 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 COG4Q9H9E3 785 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 WDR41Q9HAD4 459 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRM-205ENST00000577827 PCDHGB4Q9UN71 923 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms