RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 RGSL1A5PLK6 1076 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 A6NLC8 198 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 K7EPI3 171 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TRAF5O00463 557 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SUSD5O60279 629 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZEB2O60315 1214 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ACSL4O60488 711 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MSCO60682 206 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SMPD2O60906 423 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 NIPSNAP2O75323 286 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ERLIN2O94905 339 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 IVLP07476 585 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CLTBP09497 229 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CDK4P11802 303 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ATP1A3P13637 1013 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ITGB6P18564 788 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 LAG3P18627 525 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 LPOP22079 712 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CD38P28907 300 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ACTN2P35609 894 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GRK3P35626 688 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MSH2P43246 934 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TUFMP49411 452 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DIO1P49895 249 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RARSP54136 660 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MAP3K7CLP57077 242 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SLC8A3P57103 927 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 VBP1P61758 197 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TNFAIP2Q03169 654 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HGFACQ04756 655 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DDR1Q08345 913 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SLC14A1Q13336 389 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CUL1Q13616 776 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GTF2H3Q13889 308 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DOC2AQ14183 400 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PCOLCEQ15113 449 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 STILQ15468 1287 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 INSCQ1MX18 579 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PM20D1Q6GTS8 502 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CYB5RLQ6IPT4 315 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC62Q6P9F0 684 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 AAGABQ6PD74 315 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZYG11AQ6WRX3 759 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MRGPREQ86SM8 312 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CEP97Q8IW35 865 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 WDR63Q8IWG1 891 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CNTD1Q8N815 330 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 C2orf69Q8N8R5 385 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 KIF18AQ8NI77 898 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CEP76Q8TAP6 659 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CAGE1Q8TC20 777 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SLC26A7Q8TE54 656 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 WASF1Q92558 559 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 KIFAP3Q92845 792 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CUL5Q93034 780 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GTF3C6Q969F1 213 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 VPS50Q96JG6 964 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 NLRP4Q96MN2 994 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MNTQ99583 582 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TBCDQ9BTW9 1192 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PHF20Q9BVI0 1012 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf21Q9H246 121 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 KIF9Q9HAQ2 790 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SPON1Q9HCB6 807 aa3.22□□□□□ -1.89
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