RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 EMC10Q5UCC4 262 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM171A1Q5VUB5 890 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 HOOK3Q86VS8 718 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC25Q86WR0 208 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM71DQ8N9W8 422 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM76AQ8TAV0 307 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 C10orf88Q9H8K7 445 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 LTBP2Q14767 1821 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 H3BRJ5 948 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 CXCR3P49682 368 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 EFHC2Q5JST6 749 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 AGBL2Q5U5Z8 902 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF280DQ6N043 979 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 PYROXD2Q8N2H3 581 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC43Q8N309 656 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBKBP1A7MCY6 615 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 H7C0C1 242 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D4O60343 1298 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTC4O95801 387 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 GOT1P17174 413 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP5OP48047 213 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC5A3P53794 718 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTXN3Q4LDR2 81 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 FUT10Q6P4F1 479 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPIL6Q8IXY8 311 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF139Q8WU17 664 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 HEY1Q9Y5J3 304 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGLV3-25P01717 112 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 HCAR3P49019 387 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEMA3BQ13214 749 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 C16orf59Q7L2K0 433 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCAMP5Q8TAC9 235 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM66O15016 1216 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFFO1Q0D2I5 559 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 IKBKEQ14164 716 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARHGEF4Q9NR80 690 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABCC13Q9NSE7 274 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM51Q9NW97 253 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 DDIT4Q9NX09 232 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 EFEMP2O95967 443 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 SHBGP04278 402 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 AMPD1P23109 780 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMARCB1Q12824 385 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARL13BQ3SXY8 428 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 NAT8LQ8N9F0 302 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 CPT1BQ92523 772 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 EDEM1Q92611 657 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 FGBP02675 491 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 GBE1Q04446 702 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 CBLBQ13191 982 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 DPYSQ14117 519 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 C4orf22Q6V702 233 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 OLFM3Q96PB7 478 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL37Q9NZH6 218 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC45A4Q5BKX6 768 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 OTOP2Q7RTS6 562 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADAM32Q8TC27 787 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 PGM2Q96G03 612 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 PWWP2AQ96N64 755 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 NINJ2Q9NZG7 142 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 DTLQ9NZJ0 730 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 COX16Q9P0S2 106 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAK5Q9P286 719 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 HCSTQ9UBK5 93 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 HACD1B0YJ81 288 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 H7C4K7 107 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 I6L893 689 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 DGKIO75912 1065 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 KRT71Q3SY84 523 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 TAC4Q86UU9 113 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 CEP57Q86XR8 500 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANLNQ9NQW6 1124 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 ETNK2Q9NVF9 386 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCML2Q9UQR0 700 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLXNA3P51805 1871 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms