RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569304.1

RAB11A-208, Transcript of RAB11A, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB11A, Length 347 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11A-208	ENST00000569304	ELF1	P32519	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	LIFR	P42702	1097 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	RXRG	P48443	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PDE1A	P54750	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	NR1H2	P55055	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	FOXL2	P58012	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	DGCR2	P98153	550 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MAPK7	Q13164	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	FAR2	Q96K12	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	STX16	O14662	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	CYP3A4	P08684	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	NR2F6	P10588	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	DIO1	P49895	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TPTE	P56180	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PDCL	Q13371	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	HYI	Q5T013	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	KAZN	Q674X7	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304		Q6ZNX1	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	NPAS1	Q99742	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304		B4E171	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	CES2	O00748	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	SEPT4	O43236	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TSPAN3	O60637	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TGM1	P22735	817 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TSPAN7	P41732	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PSG6	Q00889	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TLE3	Q04726	772 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	FOXE3	Q13461	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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