RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559373.1

TSPAN3-206, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN3, Length 393 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-206ENST00000559373 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 SLC8A3P57103 927 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF33AQ06730 810 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 CACUL1Q86Y37 369 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 TTC39CQ8N584 583 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 DEFB124Q8NES8 71 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 DDI1Q8WTU0 396 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 TFAP2BQ92481 460 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 CEP295Q9C0D2 2601 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN3-206ENST00000559373 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 E7ENQ6 273 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 MAOBP27338 520 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 CHKAP35790 457 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 IL12RB1P42701 662 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 FMO5P49326 533 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 BCAT1P54687 386 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 FOXC1Q12948 553 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 ST3GAL2Q16842 350 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 TMEM270Q6UE05 265 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 SPATA20Q8TB22 786 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 DCLK3Q9C098 648 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 HESX1Q9UBX0 185 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 KNL1Q8NG31 2342 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 BIN1O00499 593 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 GABBR2O75899 941 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 LRRC63Q05C16 580 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 FUT11Q495W5 492 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 TMEM215Q68D42 235 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 UBR7Q8N806 425 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 O00370 1275 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 VDRP11473 427 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 SGSHP51688 502 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 LMAN2Q12907 356 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 SLC36A4Q6YBV0 504 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 RRAGAQ7L523 313 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 RGL4Q8IZJ4 473 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 CIPCQ9C0C6 399 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 PSMA7O14818 248 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 NDUFS2O75306 463 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 CYBBP04839 570 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 BMP6P22004 513 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 PRKCHP24723 683 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 STX17P56962 302 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 BECN1Q14457 450 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF234Q14588 700 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 RNF139Q8WU17 664 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 SPEGQ15772 3267 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 KCNJ18B7U540 433 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF217O75362 1048 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 HLA-EP13747 358 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 NUCB2P80303 420 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 STIM1Q13586 685 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 PKDCCQ504Y2 493 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 PMF1Q6P1K2 205 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 CPXM2Q8N436 756 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF366Q8N895 744 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms