RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556339.5

ATXN3-240, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 525 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-240	ENST00000556339	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	LAG3	P18627	525 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ADRA1B	P35368	520 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	BMPR1A	P36894	532 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	LIFR	P42702	1097 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	AK2	P54819	239 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	GHRHR	Q02643	423 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SYCP1	Q15431	976 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CLUL1	Q15846	466 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CFAP45	Q9UL16	551 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TTC3	P53804	2025 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339		H3BNC9	293 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MASP2	O00187	686 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	OPA1	O60313	960 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	HBP1	O60381	514 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	LPXN	O60711	386 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	STC2	O76061	302 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	FSBP	O95073	299 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	RB1	P06400	928 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	AR	P10275	920 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ALAD	P13716	330 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PROZ	P22891	400 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	KLRC1	P26715	233 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CD52	P31358	61 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ACTR2	P61160	394 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	LPIN1	Q14693	890 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	NME8	Q8N427	588 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	METTL13	Q8N6R0	699 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	REV3L	O60673	3130 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms