RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 OR2T3Q8NH03 318 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 MED8Q96G25 268 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 NMUR1Q9HB89 426 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 IL17BQ9UHF5 180 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 TACC1O75410 805 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 GARTP22102 1010 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 ABCD1P33897 745 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 RFFLQ8WZ73 363 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 HVCN1Q96D96 273 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 SMOQ99835 787 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
CS-230ENST00000551968 A8MXQ7 604 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 TNNC2P02585 160 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 MPOP05164 745 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 CDK4P11802 303 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ABCB4P21439 1286 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 C21orf59P57076 290 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 CALML4Q96GE6 196 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ACCSQ96QU6 501 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 CIPCQ9C0C6 399 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 NPC1O15118 1278 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 CYP26A1O43174 497 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 KLK10O43240 276 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 STC2O76061 302 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 C7P10643 843 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 NFKB2Q00653 900 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 FUKQ8N0W3 1084 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 GPD1LQ8N335 351 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 UCMAQ8WVF2 138 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 MED10Q9BTT4 135 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 MTG2Q9H4K7 406 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 CYLDQ9NQC7 956 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 KRT82Q9NSB4 513 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 A0A1W2PR77 199 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 DFNA5O60443 496 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 AP1G2O75843 785 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 GCNT3O95395 438 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 MT-CO3P00414 261 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 CCDC130P13994 396 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 UBA7P41226 1012 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 BCAT1P54687 386 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 VAC14Q08AM6 782 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 BROXQ5VW32 411 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 KIAA0895LQ68EN5 471 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 TMEM245Q9H330 911 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 A0A1W2PPC4 97 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 A0A1W2PQH9 124 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 TERTO14746 1132 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 CKMT2P17540 419 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 UCNP55089 124 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 NFATC3Q12968 1075 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 KCNJ12Q14500 433 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-230ENST00000551968 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms